《水經注疏》，40卷，由清末學者楊守敬、熊會貞合撰，是歷來《水經注》諸版本中注疏量最大的版本，也是公認的一部《水經注》研究集大成之作，在酈學研究史上占有獨特的地位。是書稿鈔本存世僅三部，其中日本京都大學人文科學研究所藏鈔本長期不爲國内學界所知。本次整理即以京都大學藏鈔本爲底本，主要和1971年臺北中華書局影印《楊熊合撰〈水經注疏〉》本對校，并參考江蘇古籍出版社1989年版《水經注疏》及其他相關諸本，進行標點、文字處理、校勘等工作，便于學者進一步研究和利用。